Η εσωτερικευμένη ομοφοβία πολλές φορές είναι χειρότερη της κοινωνικής, διότι το άτομο τρέφει συναισθήματα ενοχικότητας, ενώ δεν είναι σε θέση να προασπίσει τον εαυτό του στα εξωτερικά αρνητικά ερεθίσματα.